BIOLOGI GONZAGA: January 2015

Friday, January 30, 2015

LATIHAN UJIAN NASIONAL BIOLOGI 2015

NGAJARIN SISTEM PENCERNAAN ANAK SD

Ini pengalaman saja mengajari anak SD yang selalu meminta lebih untuk belajar pencernaan sungguh merupakan tantangan akhirnya dari pengalaman itu saya sharekan untuk memberikan materi ini ke anak anak itu maksudnya anak anak SD yang magis maksudnya anak anak SD yang maju begitu dah OK

APA ITU HORMON TUMBUHAN

Faktor Internal pertumbuhan selain ditentukan oleh gen ternyata juga ditentukan oleh sekret berupa getah yaitu hormon tumbuh (fitohormon) yang memacu pertumbuhan tumbuhan dan proses proses fisiologis yang terjadi pada pertumbuhan tanaman

Zat pengantur tumbuh adalah senyawa organic bukan nutrisi tanaman yang aktif dalam jumlah kecil yang disintensiskan pada bagian tertentu tanaman dan pada umumnya diangkut ke bagian lain tanaman dimana Zat tersebut menimbulkan tanggapan secara biokimia,fisiologis dan morfologis. Zat pengantur tumbuh yang umumdigunakan dalam kultur in vitro adalah golongan auksin dan sitokinin

Zat pengatur tumbuh (ZPT) memainkan peranan yang penting melalui pengaruhnya pada pembelahan sel dan diferensiasi sel selama terjadinya perkembangan dari zigot sampai perkecambahan biji, pertumbuhan vegetatif dan reproduktif. ZPT alami dan senyawa buatan adalah zat yang dapat mengubah pertumbuhan dan perkembangan tanaman, nama senyawa tersebut dapat juga pada kegiatan fisiologisnya, misal : Zat tumbuh daun, akar, dsb.

Bagaimana membedakan Zat pengatur tumbuh dan Fitohormon atau Hormon tanaman
More (1989) membedakan antara hormon tanaman dan ZPT sebagai berikut

Hormon tanaman adalah senyawa organik bukan nutrisi yang aktif dalam jumlah kecil kurang lebih 1 mili mikron , Hormon diproduksi oleh tanaman pada bagian organ tertentu , umunya ditranslokasikan ke bagian organ lain tanaman , kebanyakan hormon yang diproduksi dan kemudian ditransportasikan itu menghasilkan sustu respon secara biokimia , fidiologis dan kenampakan morfologis tanaman yang dipengaruhinya
Zat pengatur tumbuh (ZPT) adalah senyawa organik bukan nutrisi yang dalam konsentrasi rendah kurang dari 1 mili mikron mampu mendorong , atau menghambat atau secara kualitatif mengubah pertumbuhan dan perkembangan tanaman

Agar hormon tumbuhan yang terdapat dalam jumlah yang relatif sangat kecil bersifat aktif dan khas, dapat di pastikan harus ada tiga syarat utama dalam sistem respon. Yang pertama, hormon harus ada dalam jumlah yang cukup dalam sel yang tepat. Kedua, hormon harus dikenali dan diikat erat oleh setiap kelompok sel yang tanggap terhadap hormon (sel sasaran yang peka). Dan untuk ini diperlukan protein penerima yaitu suatu protein yang memiliki struktur komplek yang dapat mengenali dan memilih diantara molekul yang jauh lebih kecil. Ketiga, protein penerima tersebut (konfigurasinya diduga berubah saat menerima hormon) harus dapat menyebabkan perubahan metabolik lain yang mengarah pada penguatan isyarat atau kurir hormon

Hormon tumbuhan adalah senyawa organik yang disintesis oleh salah satu bagian tanaman dan dipindahkan ke bagian tanaman yang lain. Pada konsentrasi yang sangat rendah hormon mampu menimbulkan suatu respon fisiologis, dan juga menyatakan bahwa hormon yang sudah dikenal sampai sekarang hanya ada 5 kelompok walaupun masih banyak lagi yang dipastikan di temukan. Kelima kelompok yang sudah di kenal itu meliputi 4 macam auksin, berbagai macam giberellin (tercatat 86 macam), beberapa sitokinin, asam absisat dan etilen.

Titik-titik dalam proses ekspresi gen yang menunjukkan bagaimana aktivitas atau peran hormon pada prinsipnya dapat dikelompokkan atas peran hormon pada membran, substrat dan pada enzim.

Hormon mempengaruhi permeabilitas membran. Pengaruhnya dapat meningkatkan atau menurunkan. Bila permeabilitasnya meningkat maka akan mengakibatkan kemampuan selektivitas menurun, sehingga memacu masuknya ion-ion atau senyawa-senyawa ke dalam sel. Sedangkan bila permeabilitasnya menurun maka akan mengakibatkan selektifitas meningkat sehingga akan mengurangi masuknya ion-ion atau senyawa tertentu ke dalam sel. Kemampuan selektivitas memungkinkan masuknya ion tertentu dan menghambat ion yang lain, sehingga konsentrasi ion tertentu di dalam sel akan meningkat dibandingkan dengan di luar sel. Artinya bahwa substrat di luar sel tidak sama dengan substrat di dalam sel.
Hormon mampu menghambat atau mempercepat terbentuknya kompleks enzim-substrat, artinya dengan posisi demikian hormon mempunyai peran dapat mendorong percepatan reaksi enzimatik atau menghambat. Pada reaksi enzimatik agar terbentuk produk, terlebih dahulu substrat harus berikatan dengan enzim membentuk kompleks-enzim-substrat.
Hormon dapat mempercepat penyediaan atau pembentukan : atp. Koenzim, kofaktor, dan vitamin pada reaksi enzimatik, karena efektifitas kerja enzim sangat memerlukan hal-hal di atas.
Hormon sendiri berfungsi sebagai koenzim, sehingga enzim yang sebelumnya tidak aktif menjadi aktif berfungsi. Untuk dapat aktif enzim memerlukan koenzim, atau dapat pula hormon itu hanya berfungsi sebagai pengaktif saja.
Hormon berfungsi sebagai pengaktif, jika pada enzim terdapat inhibitornya. Seperti diketahui bahwa enzim dapat menjadi tidak aktif bila terdapat hambatan (inhibitor). Bila yang terjadi adalah inhibitor kompetitif hormon dapat membantu dengan cara meningkatkan konsentrasi substrat atau enzimnya. Sedangkan bila yang terjadi adalah inhibitor non kompetitif maka hormon bertindak sebagai penangkap atau pengikat inhibitor nin kompetitifnya hingga hambatan menurun dan reaksi berjalan.
Hormon dapat berperan sebagai pengaktif prekrusor enzim, dalam hal ini hormon berperan sebagai scond massenger pada sistesis protein sehingga percepatan reaksi dapat terjadi.
Hormon sebagai pengatur efek allosterik (sebagai efektor),
Hormon dapat mempengaruhi langsung dalam aktifitas sintesis protein.

SECOND OPINI

Hormon (dari bahasa Yunani, όρμή: horman – “yang menggerakkan”) adalah pembawa pesan kimiawi antarsel atau antarkelompok sel.
Semua organisme multiselular, termasuk tumbuhan (lihat artikel hormon tumbuhan/fitohormon diatas ), memproduksi hormon.
Hormon berfungsi untuk memberikan sinyal ke sel target yang selanjutnya akan melakukan suatu tindakan atau aktivitas tertentu.

Tindakan yang dilakukan karena pesan hormon sangat bervariasi, termasuk di antaranya adalah perangsangan atau penghambatan pertumbuhan serta apoptosis (kematian sel terprogram), pengaktifan atau penonaktifan sistem kekebalan, pengaturan metabolisme dan persiapan aktivitas baru (misalnya terbang, kawin, dan perawatan anak), atau fase kehidupan (misalnya pubertas dan menopause).

Pada banyak kasus, satu hormon dapat mengatur produksi dan pelepasan hormon lainnya.
Hormon juga mengatur siklus reproduksi pada hampir semua organisme multiselular.

Pada hewan, hormon yang paling dikenal adalah hormon yang diproduksi oleh kelenjar endokrin vertebrata.

Walaupun demikian, hormon dihasilkan oleh hampir semua sistem organ dan jenis jaringan pada tubuh hewan.
Molekul hormon dilepaskan langsung ke aliran darah, walaupun ada juga jenis hormon – yang disebut ektohormon (ectohormone) – yang tidak langsung dialirkan ke aliran darah, melainkan melalui sirkulasi atau difusi ke sel target.

Pada prinsipnya pengaturan produksi hormon dilakukan oleh hipotalamus (bagian dari otak). Hipotalamus mengontrol sekresi banyak kelenjar yang lain, terutama melalui kelenjar pituitari, yang juga mengontrol kelenjar-kelenjar lain. Hipotalamus akan memerintahkan kelenjar pituitari untu mensekresikan hormonnya dengan mengirim faktor regulasi ke lobus anteriornya dan mengirim impuls saraf ke posteriornya dan mengirim impuls saraf ke lobus posteriornya.

Pada tumbuhan, hormon dihasilkan terutama pada bagian tumbuhan yang sel-selnya masih aktif membelah diri (pucuk batang/cabang atau ujung akar) atau dalam tahap perkembangan pesat (buah yang sedang dalam proses pemasakan). Transfer hormon dari satu bagian ke bagian lain dilakukan melalui sistem pembuluh (xilem dan floem) atau transfer antarsel. Tumbuhan tidak memiliki kelenjar tertentu yang menghasilkan hormon.

Faktor Regulasi

Faktor regulasi adalah senyawa kimia yang mengontrol produksi sejumlah hormon yang memiliki fungsi penting bagi tubuh. Senyawa tersebut dikirim ke lobus anterior kelenjar pituitari oleh hipotalamus. Terdapat 2 faktor regulasi, yaitu faktor pelepas (releasing factor) yang menyebabkan kelenjar pituitari mensekresikan hormon tertentu dan faktor penghambat (inhibiting factor) yang dapat menghentikan sekresi hormon tersebut. Sebagai contoh adalah FSHRF (faktor pelepas FSH) dan LHRF (faktor pelepas LH) yang menyebabkan dilepaskannya hormon FSH dan LH.

Hormon Antagonistik

Hormon antagonistik merupakan hormon yang menyebabkan efek yang berlawanan, contohnya glukagon dan insulin. Saat kadar gula darah sangat turun, pankreas akan memproduksi glukagon untuk meningkatkannya lagi. Kadar glukosa yang tinggi menyebabkan pankreas memproduksi insulin untuk menurunkan kadar glukosa tersebut

HORMON KOLEOSISTOKININ

Dipembelajaran biologi kelas XI tentang Sistem Pencernaan Hormon ini disinggung sekilas tidak jelas dan terlihat tidak dipentingkan , namun ketika di ujian justru hormon ini sering ditanyakan atau lebih mudahnya keluar dalam ujian baik Test harian maupun test perguruan tinggi maka alangkah baiknya kalau diketahui lebih jelas hal hal yang disinggung di buku yang sekilas itu OK

Koleosistokinin merupakan hormon yang menyebabkan kontraksi kandung empedu sering disingat CCK.

Akibat terjadi kontraksi pada otot Vesica fellea ini isi kantong berupa cairan emepedu yang mengandung bilirubin dan biliverdin ini keluar ke usus 12 jari atau Duodenum melalui saluran pancreas untuk membantu pencernaan lemak dengan cara mengemulsikannya

Selain itu Koleosistokinin adalah hormon yang mendorong hormon Sekretin untuk ikut membantu pencernaan yaitu meningkatkan sekresi getah pankreas berupa enzim Tripsin , Lipase dan Amilase untuk disekresikan ke Duodenum .

Koleosistokinin juga menguatkan kerja sekretin, menghambat pengosongan lambung, menimbulkan efek tropik (pertumbuhan mukosa) pada pankreas, meningkatkan sekresi enterokinase

Koleosistokinin dapat juga meningkatkan gerakan usus halus Dan kolon.

Koleosistokinin disekresi oleh sel-sel endokrin antara lain

Sel-sel di Usus bagian atas
Saraf Ileum distales
Sel di jejunum
Sel sel endokrin di Usus 12 Jari terutama CCK8 Dan CCK12

Sekresi Koleosistokinin meningkat bila hasil pencernaan berupa bollus ataupun chime dari lambung berkontak dengan mukosa usus 12 jari , khususnya Lemak yang akan dibentuk emulsi lemak oleh empedu .

Adanya empedu dan getah pankreas yang memasuki usus 12 jari yang tersekresi dan mencernakan lemak dengan mengemulsikannya dan lebih lanjut enzim TLA (Tripsin , Lipase dan Amilase ) menguraikan masing masing substratnya maka seterusnya merangsang hormon Koleosistokinin untuk Umpan balik mengakhiri sekresinya sehingga jumlahnya menjadi berkurang dengan hasil-hasil pencernaan bergerak ke bagian distales saluran cerna Yeynum OK

Jadi Saluran Pencernaan Mukosa usus halus menghasilkan hormon Sekretin untuk mengaktifkan Pancreas mengeluarkan getahnya dan Kolesistokinin mengaktifkan Kantong empedu mensekresikan isinya

Hormon sekretin disintesis dan disekresikan oleh mukosa usus halus (terutama jejunum) ke dalam sirkulasi darah ketika makanan yang sangat bersifat asam memasuki usus halus. Hormon sekretin apabila disuntikkan secara intravena akan meningkatkan sekresi bikarbonat oleh pankreas dan saluran empedu.

Hormon kolesistokinin disintesis dan disekresikan oleh mukosa usus halus bagian depan (terutama duodenum) memiliki peran merangsang motilitas kantung empedu.

Kolesistokinin dibebaskan ketika makanan yang mengandung lemak memasuki duodenum. Kolesistokinin berperan merangsang sel asinar pankreas untuk mengeluarkan enzim-enzim pencernaan dan kontraksi kantung empedu untuk mengeluarkan getah empedu ke lumen usus halus.

Peran Koleosistokinin dalam pencernaan

Ketika makanan mulai dicerna di dalam traktus gastrointestinal bagian atas, kandung empedu mulai dikosongkan, terutama sewaktu makanan berlemak masuk ke duodenum sekitar 30 menit setelah makan. Dasar yang menyebabkan pengosongan adalah kontraksi ritmik dinding kandung empedu, tetapi efektivitas pengosongan juga membutuhkan relaksasi yang bersamaan dari sfingter Oddi yang menjaga pintu keluar duktus biliaris komunis ke dalam duodenum.

Sejauh ini rangsangan yang paling poten dalam menyebabkan kontraksi kandung empedu adalah hormone kolesistokinin. Hormone ini adalah hormone yang sama yang menyebabkan peningkatan sekresi enzim oleh sel-sel asinar pancreas. Rangsangan untuk melepaskan kolesistokinin ke dalam darah dari mukosa duodenum terutama adalah makanan berlemak yang masuk ke duodenum.

Selain kolesistokinin, kandung empedu juga dirangsang secara kurang kuat oleh serat-serat saraf yang menyekresi asetilkolin dari system syaraf fagus dan enteric. Keduanya adalah saraf yang sama yang meningkatkan motilitas dan sekresi dalam bagian lain traktus gastrointestinal bagian atas.

Bahkan dengan kontraksi kandung empedu yang relative kuat, pengosongan dapat berlangsung suli karena sfingter Oddi normalnya tetap berkontraksi secara tonik. Oleh karena itu, sebelum terjadi pengosongan kandung empedu, sfingter Oddi, juga harus direlaksasi. Paling sedikit ada tiga factor yang membantu hal ini : Pertama, kolesistokinin, bukannya merangsang sfingter Oddi, malah memiliki efek relaksasi. Tetapi efek ini saja biasanya tidak cukup untuk memungkinkan pengosongan yang bermakna. Kedua, kontraksi ritmik kandung empedu menghantarkan gelombang peristaltic melalui duktus biliaris biliaris komunis menuju sfingter Oddi, menyebabkan suatu gelombang awal relaksasi yang sebagian menghambat sfingter mendahului gelombang peristaltic. Tetapi ini, juga, biasanya tidak cukup untuk menghasilkan pengosongan dalam jumlah besar. Ketiga, ketika gelombang peristaltic usus berjalan pada dinding duodenum, fase relaksasi dari setiap gelombang dengan kuat merelaksasi otot dinding usus. Sejauh ini hal tersebut kelihatannya merupakan efek yang paling kuat dari semua relaksan pada sfingter Oddi. Akibatnya empedu biasanya masuk ke duodenum dalam bentuk pancaran yang sinkron dengan fase relaksasi gelombang peristaltic duodenum.

Sebagai ringkasan, kandung empedu mengosongkan simpanan empedu pekatnya ke dalam duodenum terutama sebagai respon terhadap perangsangan kolesistokinin. Saat lemak tidak terdapat dalam makanan, pengosongan kandung empedu berlangsung buruk. Tetapi apabila terdapat jumlah lemak yang banyak dalam makanan, normalnya kandung empedu akan kosong secara menyeluruh dalam waktu sekitar 1 jam.

Thursday, January 29, 2015

SIKLUS KIMIA OLEH MAHKLUK HIDUP KE DAN DARI LINGKUNGAN

Daur Biogeokimia :

Pertukaran atau perubahan yang terus menerus, antara komponen biosfer yang hidup dengan tak hidup.
Dalam suatu ekosistem, materi pada setiap tingkat trofik tidak hilang.
Materi berupa unsur-unsur penyusun bahan organik tersebut didaur-ulang.
Unsur-unsur tersebut masuk ke dalam komponen biotik melalui udara, tanah, dan air.
Daur ulang materi tersebut melibatkan makhluk hidup dan batuan (geofisik)

Fungsi Daur Biogeokimia

Sebagai siklus materi yang mengembalikan semua unsur-unsur kimia yang sudah terpakai oleh semua yang ada di bumi baik komponen biotik maupun komponen abiotik, sehingga kelangsungan hidup di bumi dapat terjaga.

Macam-macam daur biogeokimia yang akan kita pelajari:

Daur Air/siklus hidrologi
Daur Karbon
Daur Nitrogen
Daur Fosfor
Daur sulfur/belerang

1.Daur Air/H2O (daur/siklus hidrologi)

Merupakan hal yang penting dalam keberlangsungan daur air alami.

Skema siklus hidrologi :

Air di atmosfer berada dalam bentuk uap air
Uap air berasal dari air di daratan dan laut yang menguap (Evaporasi) karena panas cahaya matahari dan karena penguapan oleh tumbuhan (Transpirasi)
Sebagian besar uap air di atmosfer berasal dari laut karena laut mencapai tiga perempat luas permukaan bumi.
Uap air di atmosfer terkondensasi menjadi awan yang turun ke daratan dan laut dalam bentuk hujan (Presipitasi)
Pada perjalanan menuju bumi beberapa presipitasi dapat berevaporasi kembali ke atas atau langsung jatuh yang kemudian diserap oleh tanaman sebelum mencapai tanah.
Setelah mencapai tanah, siklus hidrologi terus bergerak secara terus menerus dalam tiga cara yang berbeda :

1. evaporasi / transpirasi

Air yang ada di laut, di daratan, di sungai, di tanaman akan menguap menjadi awan
Pada keadaan jenuh uap air (awan) itu akan menjadi bintik-bintik air yang selanjutnya akan turun (precipitation) dalam bentuk hujan, salju atau es.

2. infiltrasi/perlokasi

Air bergerak ke dalam tanah melalui celah-celah dan pori-pori tanah dan batuan menuju muka air tanah.
Air dapat bergerak akibat aksi kapiler atau air dapat bergerak secara vertikal atau horizontal dibawah permukaan tanah hingga air tersebut memasuki kembali sistem air permukaan.

3. Air Permukaan

Air bergerak diatas permukaan tanah dekat dengan aliran utama dan danau makin landai lahan dan makin sedikit pori-pori tanah, maka aliran permukaan semakin besar.

2. Daur/siklus Karbon (C)

Siklus ini berkaitan dengan siklus oksigen
Siklus karbon berkaitan erat dengan peristiwa fotosintesis yang berlangsung pada organisme autotrof dan peristiwa respirasi yang berlangsung pada organisme heterotrof
Carbon diambil/diserap oleh tumbuhan dari lingkungan untuk fotosintesis dalam bentuk CO2
CO2 dilepas ke lingkungan oleh semua organisme baik heterotrof maupun autotrof yang merupakan hasil sampingan dari peristiwa respirasi
Proses timbal balik fotosintesis dan respirasi seluler berpengaruh terhadap perubahan dan pergerakan utama karbon.
Naik turunnya kadar CO2 dan O2 atsmosfer secara musiman disebabkan oleh aktivitas fotosintetik.
Dalam skala global kadar CO2 dan O2 atsmosfer dapat diseimbangkan oleh keberlangsunag proses respirasi dan fotosintesis aktifitas manusia dan alam seperti penggunaanbahan bakar fosil untuk industrialisasi dan transportasi, kebakaran hutan, pembakaran hutan untuk lahan pertanian dan illegal logging dapat meningkatkan kadar CO2 di atmosfer
Karbon dalam tanah ditemukan dalam bentuk fosil berupa minyak bumi (fosil hewan) dan batubara (fosil tumbuhan)

Berikut adalah skema siklus Karbon :

Short Cut :

Pada siklus carbon ini mudah sekali dipahami bila ada tanda panah kebawah dari udara pasti menuju ketumbuhan karena ia yang bisa menyerapnya maka tanda panah kebawah pasti Fotosintesis
Jika tanda panahnya keatas pasti dari semua organisme karea semua melakukan oksidisasi atau respirasi untuk bisa mendapatkan energi untuk aktivitas
Jika tanda panah di bawah tanah bisa penguraian kalau organisme itu mati ( dekomposisi) dan diuraikan dekomposer
Hasil urainnya Carbon atau abunya diserap oleh akar tumbuhan dalam bentuk abu anorganik
Jika ke udara dalam bentuk asap gas yang terdapat partikulat padat misalnya pembakaran sampah /hutan disebut pembakaran
Begitu juga dari hasil pembakaran bahan bakar fosil misalnya minyak bumi atau batubara OK

3. daur/siklus nitrogen

Nitrogen di udara sekitar 78 % dalam bentuk nitrogen bebas
Organisme membutuhkan nitrogen dalam bentuk senyawa
Organisme tingkat tinggi tidak dapat dengan mudah mengikat (memfiksasi) nitrogen bebas
Mikroorganisme berperan dalam fiksasi nitrogen ke tubuh organisme tingkat tinggi (terutama tumbuhan)
Bagaimana senyawa nitrogen dapat berada di daratan/tanah, dalam bentuk larutan, di udara dan pada tubuh makhluk hidup,

Perhatikan Skema siklus nitrogen berikut !

Lebih jelasnya demikian

Keterangan

Nitrifikasi
Nitrafikasi
Assimilasi
Denitrifikasi : apabila oksigen dalam tanah terbatas, nitrat dengan cepat ditransformasikan menjadi gas nitrogen atau oksida nitrogen
Fiksasi
Amonifikasi

Skema nitrifikasi dan nitrasi

Nitritasi : penguraian amonia menjadi nitrit dengan bantuan Nitrosomonas dan Nitrosococcus (amonia dan nitrit bersifat toksik pada organisme

Nitrasi : perubahan senyawa nitrit menjadi nitrat (tidak bersifat toksik) oleh Nitrobacter.

Urutan Proses daur Nitrogen

Ketika petir terbentuk di atmosfer terjadi penyerapan nitrogen menjadi senyawa nitrat.
Nitrat yang terbentuk di atmosfer tentu akan terbawa hujan sehingga terjadi perpindahan nitrat dari udara ke daratan yang menjadikan nitrogen dalam bentuk nitrat itu menjadi berguna
Tumbuhan menyerap nitrat dari tanah untuk dijadikan protein
Nitrogen dalam bentuk protein diserap oleh Kosumen, senyawa nitrogen pindah ke tubuh hewan dan manusia
Urin dan feces sebagai Ekresta
Bangkai hewan,tumbuhan mati , sisa kehidupan (ranting, daun tua) yang disebut Egesta akan diuraikan oleh pengurai jadi ammonium dan ammoniak (amonifikasi)
Amoniak hasil pembusukan itu oleh bakteri Nitrifikan akan dirombak jadi Nitrit melalui
Nitrifikasi (Nitrifikasi adala proses biokimia yang tergolong anabolisme mengubah senyawa sederhana anorganik berupa amoniak NH3 menjadi senyawa anorganik nitrat HNO3 dengan menghasilkan energi
Energi itulah yang kemudian digunakan oleh bakteri nitrifikans (energi berasal dari energi hasil reaksi kimia /khemosintesis oleh bakteri) yang akan digunakan untuk membentuk glukosa sebagai bahan organik dari karbon dioksida (anorganik ) OK
Nitrat sebagai bahan anorgai akan diserap kembali oleh tumbuhan jadi nitrat bukan organik karena tumbuhan tidak memerlukan organik langsung dari lingkungan .
Selain melalui petir juga penyerapan nitrogen dapat melalui fiksasi (pengikatan langsung Nitrogen di udara oleh mikroorganisme Fiksasi

Mikroorganisme yang mampu Memfiksasi Nitrogen adalah (Note Fiksasi beda dengan Nitrifikasi OK)

Rhizobium leguminosarum
Azotobacter
Clostridium pasteurianum
Nostoc cummune,
Anabaena azzolae)

Detail

Rhizobium leguminosarum : bersimbiosis dengan kacang kacangan membentuk bintil akar

Anabaena azzolae : bersimbiosis dengan paku air (Azolla pinata) dan pakis haji (Cycas rumpii)

Azotobacter, Clostridium pasteurianum dan Nostoc commune hidup soliter

Nitrogen juga bisa larut bersama air hujan, hujan asam ( acid rain) yang mengandung HNO3, dari pupuk buatan Urea yang dilepaskan ke tanah

4. Daur/siklus Fosfor

Fosfor merupakan elemen penting dalam kehidupan karena semua makhluk hidup membutuhkan fosfor/ phosphat untuk pembentukan senyawa ATP (adenosin triphosphat), ADP (adenosin diphosphat), dan AMP (adenosin monophosphat) untuk proses metabolisme tubuh.
Pada Hewan tingkat tinggi fosfor digunakan untuk penusun tulang yang ditulang bergabung dengan Calsium membeentuk CaPO4 (Calsium Phosphat
Fosfor terdapat di alam dalam bentuk ion fosfat (PO4)/fosfat anorganik
Ion Fosfat terdapat dalam bebatuan.
Adanya peristiwa erosi dan pelapukan menyebabkan fosfat terbawa menuju sungai hingga laut membentuk sedimen.
Adanya pergerakan dasar bumi menyebabkan sedimen yang mengandung fosfat muncul ke permukaan.
Di darat tumbuhan mengambil fosfat yang terlarut dalam air tanah sehingga terjadi perpindahan materi dari geo ke bio dari alam ke tubuh organisme
Fosfat itulah kemudian dikenal dengan fosfat organik
Herbivora mendapatkan fosfat dari tumbuhan yang dimakannya dan karnivora mendapatkan fosfat dari herbivora yang dimakannya.
Seluruh hewan mengeluarkan fosfat melalui urine dan feses.
Bakteri dan jamur mengurai bahan-bahan anorganik di dalam tanah lalu melepaskan fosfor kemudian diambil oleh tumbuhan.

e. Daur Belerang/Sulfur (S)

Sulfur merupakan unsur non logam
Bentuk aslinya adalah sebuah zat padat kristal
Mineral Sulfur ini berwarna kuning
Sulfur di alam ditemukan sebagai unsur murni atau sebagai mineral- mineral sulfida dan sulfat
Sulfur teradapat di udara karena adanya aktifitas gunung berapi dan penggunaan dari bahan bakar fosil (menghasilkan SO2)
Unsur penting untuk kehidupan Sulfur ditemukan dalam bentuk senyawa asam amino (CHONSP)
Tumbuhan mendapat sulfur dari dalam tanah dalam bentuk sulfat organik (SO4 ).
Sulfur berpindah ke organisme heterotrof dalam proses rantai makanan
Penguraian organisme yang mati mengasilkan gas H2S atau menjadi sulfat lagi.
Sulfur direduksi oleh bakteri menjadi sulfida dan kadang-kadang terdapat dalam bentuk sulfur dioksida atau hidrogen sulfida.
Beberapa jenis bakteri terlibat dalam daur sulfur, antara lain Desulfomaculum dan Desulfibrio yang akan mereduksi sulfat menjadi sulfida dalam bentuk hidrogen sulfida (H2S).
Kemudian H2S digunakan bakteri fotoautotrof anaerob seperti Chromatium dan melepaskan sulfur dan oksigen.
Sulfur di oksidasi menjadi sulfat oleh bakteri kemolitotrof seperti Thiobacillus.

Hal yang penting yang perlu dipahami dalam siklus biogeokimia :

Unsur/materi/senyawa (kimia) akan terdapat di bumi (geo) dan dalam tubuh organisme
Perpindahan dari geo ke geo terjadi misalnya dari udara diserap oleh tanah atau lautan dengan perantara hujan, pelapukan (perubahan batuan menjadi tanah), erosi (pengikisan) dan pengendapan
Unsur/senyawa kimia dari bumi (geo) ke organisme (bio) digunakan untuk berbagai proses metabolisme
Penyerapan/perpindahan unsur/senyawa melibatkan berbagai jenis mikroorganisme yang berperan sebagai dekomposer