SIAP SIAP UJIAN NASIONAL 2017

Soal yang kami share ini adalah untuk latihan atau mereview materi Ujian Nasional 2017 semoga berguna

SOAL
1. Organel sel yang tidak bermembran adalah ....
(A) badan mikro
(B) peroksisom
(C) lisosom
(D) vakuola
(E) ribosom

2. Dalam suatu ekspedisi telah ditemukan tumbuhan dengan ciri-ciri sebagai berikut: tidak berkayu, berdaun menyirip, tidak berbunga, batang roset,daun muda menggulung. Jika Anda diminta untuk menduga, tumbuhan kelompok apakah yang Anda temukan tersebut?
(A) Angiospermeae
(B) Monokotiledonae
(C) Pterydophyta
(D) Bryophyta
(E) Gymnospermeae

3. Trenggiling (Manis javanica) merupakan salah satu spesies langka dan dilindungi di Indonesia. Hewan yang hampir seluruh permukaan tubuhnya ditutupi sisik tersebut merupakan pemakan serangga. Dalam klasififikasi hewan, trenggiling termasuk ke dalam kelompok ....
(A) kelas Reptilia karena tubuhnya bersisik
(B) kelas Insektivora karena merupakan hewan pemakan serangga
(C) kelas Mamalia karena memiliki rambut dan menyusui
(D) subkelas Squamata karena tubuh ditutupi sisik dan pemakan serangga
(E) subkelas Monotremata karena selain bersisik juga masih bertelur seperti Reptil

4. Fungsi dari neuroglia adalah ....
(A) membantu neuron dalam mempercepat hantaran impuls
(B) membantu neuron menyampaikan rangsang kemis
(C) memperkuat integritas struktur sistem saraf dan fungsi metabolis neuron
(D) membantu neuron dalam pembukaan gerbang Na+
(E) membantu neuron dalam transport kalium, eksresi, dan regenerasi

5. Lapisan sel mati yang terdiri atas beberapa lapisan jaringan epidermis pada akar udara tanaman anggrek dan berfungsi sebagai jaringan penyimpan air adalah ....
(A) kutikula
(B) trikoma
(C) spina
(D) velamen
(E) sel litosit

6. Suatu mikroorganisme menunjukkan pertumbuhan yang terbatas pada suhu 27 _C. Pertumbuhan akan terlihat sangat baik pada suhu 37 _C. Pada suhu 40 _C masih terjadi pertumbuhan, tetapi tidak ada pertumbuhan di atas suhu tersebut. Berdasarkan suhu pertumbuhan maka mikroorganisme tersebut masuk ke dalam kelompok ....
(A) psickrofilik
(B) mesofilik
(C) termotolerant
(D) termofilik
(E) psikotoleran

7. Fertilisasi mengaktifkan serangkaian reaksi yang memungkinkan menyatunya nukleus sel sperma dan sel telur. Berikut adalah reaksi yang terlibat dalam proses fertilisasi, kecuali ....
(A) reaksi akrosomal
(B) reaksi kortikal
(C) reaksi metabolik
(D) reaksi polispermi
(E) reaksi invaginasi

9. Sekuens ADN pada E. coli yang memulai proses transkripsi dinamakan ....
(A) kodon start
(B) promotor
(C) kodon stop
(D) reading frame
(E) operon

10. Karakteristik yang membedakan cairan hemolimfe Artropoda dengan darah Vertebrata adalah ....
(A) merupakan sistem peredaran tertutup
(B) peredaran cairan hemolimfe bermuara pada rongga jantung
(C) hanya berfungsi sebagai pengangkut sari makanan
(D) hanya berfungsi sebagai pengangkut oksigen
(E) cairan hemolimfe kembali ke jantung melalui pembuluh darah

11. Tumbuhan karnivor, seperti kantung semar, menjebak serangga. Apa yang diperoleh tumbuhan tersebut dari serangga? Mengapa tumbuhan tersebut menggunakan senyawa tersebut?
(A) Tumbuhan memperoleh air karena hidup pada kondisi kering.
(B) Tumbuhan memperoleh nitrogen untuk membuat gula.
(C) Tumbuhan memperoleh fosfor untuk membuat ATP.
(D) Tumbuhan memperoleh gula karena tumbuhan tersebut tidak dapat memproduksi gula yang cukup selama fotosintesis.
(E) Tumbuhan memperoleh nitrogen dan fosfor untuk membuat protein.

12. Struktur reproduksi jamur (fungi) merupakan alat utama untuk klasifikasi. Sebutkan urutan filum dari jamur berdasarkan ciri yang terlihat pada skematis gambar di atas?
(A) Ascomycota, Zygomycota, Deuteromycota , Basidiomycota
(B) Ascomycota, Basidiomycota, Zygomycota,Ascomycota
(C) Basidiomycota, Basidiomycota, Zygomycota, Ascomycota
(D) Basidiomycota, Deuteromycota, Ascomycota, Zygomycota
(E) Deuteromycota, Basidiomycota, Ascomycota, Zygomycota

13. Lemak yang dihasilkan pada biji kacang tanah merupakan ....
(A) hasil simbiosis dengan bakteri Rhizobium
(B) cadangan makanan pada tumbuhan
(C) senyawa organik yang diserap oleh bulu akar
(D) perubahan biokemis karbohidrat di dalam biji
(E) senyawa nonpolar yang dibentuk pada daun

14. DNA polimerase adalah enzim yang berperan dalam sintesis DNA yang meliputi ....
(A) proses replikasi saja
(B) proses perbaikan saja
(C) proses replikasi dan penambahan
(D) proses replikasi dan perbaikan
(E) proses penambahan dan perbaikan

15. Suatu koloni kapang holomorfis akan memperlihatkan ....
(A) bentuk sel vegetatif saja
(B) bentuk sel generatif dan sel vegetatif
(C) bentuk sel generatif aseksual saja
(D) bentuk sel generatif seksual dan aseksual
(E) bentuk sel vegetatif, sel generatif aseksual, dan seksual

16. Jenis buah yang digolongkan dalam kelompok buah semu adalah ....
(A) kenari
(B) kacang polong
(C) kacang hijau
(D) persik
(E) stroberi

17. Banyaknya lingkaran tahun pada tanaman jati dihasilkan karena adanya aktivitas ....
(A) internodus pada batang
(B) lingkaran-lingkaran berkas pembuluh pada batang tumbuhan monokotil
(C) lapisan xilem dalam batang berkayu
(D) lapisan floem dalam batang berkayu
(E) jawaban b dan c benar

19. Cairan transseluler adalah ....
(A) cairan yang terdapat dalam plasma darah
(B) cairan yang terdapat di ekstraseluler
(C) cairan yang terdapat di intraseluler
(D) cairan yang terdapat di jaringan tubuh
(E) cairan yang terdapat di tempat khusus seperti bola mata, pleura, dan persendian

20. Mitokondria pada sel seorang pasien hanya dapat menggunakan asam lemak dan asam amino untuk respirasi sel dan selnya menghasilkan asam laktat yang cukup tinggi dibandingkan dengan normal. Dari pernyataan berikut, manakah yang paling tepat untuk menjelaskan kondisinya?
(A) Mitokondrianya tidak memiliki protein transpor yang dapat memindahkan asam piruvat dari bagian luar dari membran mitokondria.
(B) Selnya mengalami kelainan pada rantai transpor elektron sehingga glukosa menjadi asam laktat, bukannya asetil-koA.
(C) Selnya mengandung sesuatu yang menghambat penggunaan oksigen oleh
mitokondria.
(D) Selnya tidak memiliki enzim glikolisis yang membentuk piruvat.
(E) Selnya tidak dapat memindahkan NADH hasil glikolisis.

21. Pernyataan yang manakah yang tidak benar dalam menggambarkan fotosintesis yang terjadi pada tanaman C4?
(A) Hasil pertama dari fiksasi C adalah senyawa dengan 4 atom karbon.
(B) Fotosintesis untuk tanaman C4 teradaptasi untuk tumbuh pada tempat yang panas dan iklim yang kering.
(C) Fiksasi CO2 berlangsung di sel mesofil, akan tetapi siklus Calvin terjadi pada seludang pembuluh.
(D) Fotorespirasi pada tanaman C4 lebih sedikit dibandingkan dengan tanaman C3.
(E) ATP yang digunakan untuk sintesis gula lebih sedikit dibandingkan dengan tanaman C3.

22. Sebagian besar ikan, amfibia, reptilia dan burung mempunyai penglihatan warna yang lebih kuat dibandingkan mamalia. Pernyataan di bawah ini yang mendukung pernyataan tersebut adalah ....
(A) Reseptor penglihatan pada kelompok mamalia tersebar di seluruh retina, tetapi sel batang hanya terdapat pada fovea.
(B) Hewan nokturnal atau diurnal menentukan jumlah relatif sel batang dan sel kerucut dalam retina.
(C) Sel batang pada kelompok hewan nokturnal (ikan, amfibia, reptilia dan burung) lebih berkembang dibandingkan mamalia.
(D) Retina mamalia lebih sedikit mengandung sel batang dibandingkan sel kerucut.
(E) Semua pernyataan benar.

23. Proses fotosintesis yang optimal di kloroplas memerlukan cahaya dengan warna ....
(A) putih
(B) biru
(C) merah
(D) hijau
(E) ungu

24. Proses inisiasi pada sintesis protein dilakukan melalui beberapa protein dan tahapan katalisis.
Katalisator yang digunakan dalam reaksi tersebut adalah ....
(A) ligase
(B) peptidil transferase
(C) topoisomerase
(D) aminoasil-tRNA sintase
(E) helikase

25. Pada sitoplasma Protozoa air tawar terdapat organel yang berfungsi sebagai osmoregulasi, yaitu
(A) plasmasol
(B) plasmagel
(C) vakuola kontratil
(D) selaput plasma
(E) plasmodesma

26. Semua hal di bawah ini berhubungan dengan pertumbuhan sekunder, kecuali ....
(A) terjadi di semua tumbuhan angiosperma
(B) terjadi karena aktivitas prokambium
(C) akibat dari aktivitas (paling tidak sebagian) kambium vaskular
(D) mengakibatkan pertambahan tinggi tanaman
(E) menghasilkan sel-sel endodermis

27. Berdasarkan perbedaan perkembangan embrionya, hewan dapat dikelompokkan menjadi kelompok hewan Protostoma dan Deterostoma. Hewan-hewan yang termasuk ke dalam kelompok (superfilum) Deterostome adalah ....
(A) ikan, kucing, dan bulu babi
(B) netmatoda, cacing gilig, dan cacing pita
(C) siput, kerang, dan keong
(D) trematoda, cestoda, dan turbelaria
(E) semut, laba-laba, dan kupu-kupu

28. Hubungan langsung antarsel seperti halnya gap junction pada sel hewan dan plasmodesmata pada sel tumbuhan memungkinkan ....
(A) sel-sel di sekitarnya untuk melekat kuat satu dengan lainnya
(B) second messenger yang diproduksi oleh satu sel akan berdifusi dengan cepat dan merangsang sel-sel di sekitarnya
(C) sel-sel di sekitarnya membentuk penghalang air yang sangat kuat di antara membran
(D) protein kinase mengalir di antara sel, mengkoordinasi respon seluler dalam suatu jaringan
(E) pertukaran informasi genetik yang sangat cepat antara sel-sel di sekitarnya

29. Ketika dalam perjalanan mendaki gunung, seorang remaja digigit oleh seekor ular berbisa. Dia hampir saja tewas akibat hemolisis atau sebagian besar sel darah merahnya lisis. Dari hasil analisis terhadap bisa ular tersebut ditemukan tiga buah enzim: fosfolipase yang mendegradasi fosfolipid; neuraminidase yang melepaskan karbohidrat pada permukaan sel; dan protease yang mendegradasi
protein. Enzim yang menyebabkan hemolisis (hampir saja berakibat fatal) adalah ....
(A) fosfolipase yang akan mendegradasi fosfolipid yang merupakan komponen membran yang mem bentuk suatu pembatas sel
(B) neuraminidase yang menghancurkan karbohidrat pada membran sel dan selanjutnya Menye babkan sel lisis
(C) protease yang akan mendegradasi protein transmembran yang akan mengakibatkan sel lisis
(D) neuraminidase yang menghancurkan karbohidrat karena karbohidrat merupakan bagian dari glikokaliks
(E) bukan salah satu jawaban di atas

30. Pada proses pembentukan urine, reabsorbsi terjadi di tubulus kontortus proksimal, lengkung Henle dan tubulus kontortus distal. Di tubulus kontortus distal terjadi ....
(A) reabsorbsi glukosa dan asam amino dengan bantuan hormon
(B) reabsorbsi air dan Ca2+ yang dikontrol paratormon
(C) reabsobsi glukosa dan ionNa+ dengan bantuan hormon
(D) reabsorbsi Na+ dan sekresi K+ yang dikontrol hormon aldosteron
(E) reabsorbsi air dan ion Cl- secara pasif

31. Semua hal di bawah ini berhubungan dengan pertumbuhan sekunder, kecuali ....
(A) terjadi di semua tumbuhan angiosperma
(B) terjadi karena aktivitas prokambium
(C) akibat dari aktivitas (paling tidak sebagian) kambium vaskular
(D) mengakibatkan pertambahan tinggi tanaman
(E) menghasilkan sel-sel endodermis

32. Pada sitoplasma Protozoa air tawar terdapat organel yang berfungsi sebagai osmoregulasi, yaitu
(A) plasmasol
(B) plasmagel
(C) vakuola kontratil
(D) selaput plasma
(E) plasmodesma
33. Pertumbuhan diartikan sebagai suat proses perubahan ukuran tubuh suatu makhluk. Berikut merupakan salah satu pertumbuhan pada tumbuhan, yakni …
a. membesarnya batang
b. berbunga
c. berbuah
d. berkecambah
e. terbentuknya rambut akar

34.Aktivitas pertumbuhan sekunder dari bagian bernomor 3 akan menghasilkan …
a. felem dan feloderm
b. ke arah dalam membentuk felem, ke arah luar membentuk felogen
c. lingkaran tahun dan kambium intravaskuler
d. ke arah dalam membentuk xilem, ke arah luar membentuk floem
e. ke arah dalam membentuk floem, ke arah luar membentuk xilem

35. Pengertian dari temperatur optimum pada proses pertumbuhan adalah …
a. temperatur tertinggi di mana tumbuhan masih dapat hidup
b. temperatur tertinggi di suatu daerah di mana tumbuhan tak dapat hidup
c. temperatur yang dapat memengaruhi tumbuhnya tumbuhan sehingga tumbuhan mudah layu
d. temperatur yang paling sesuai bagi pertumbuhan suatu jenis tumbuhan
e. temperatur terendah di mana tumbuhan masih dapat hidup

36. Suatu tumbuhan mengalami defisiensi unsur Mn2+. Hal yang akan terjadi adalah …
a. tumbuh kerdil
b. batang tumbuh lemah
c. nekrosis
d. daun muda menggulung
e. layu

37. Hormon tumbuhan yang merangsang pertumbuhan sel baru pada jaringan yang luka adalah …
a. kaulokalin
b. auksin
c. asam traumalin
d. filokalin
e. giberelin

38. Ketika tumbuhan mengalami pembelahan sel kelamin pada bunga, tahap tersebut dapat dikatakan sebagai …
a. perkembangan
b. pertumbuhan
c. regenerasi
d. etiolasi
e. reproduksi

39. Perkembangan makhluk hidup dapat diartikan sebagai …
a. penambahan bahan dan perubahan substansi yang dapat diukur
b. penambahan jumlah sel hanya pada titik tumbuh
c. pertambahan volume yang dapat diukur dan bersifat tidak dapat kembali
d. menuju kedewasaan dan tidak dapat diukur
e. perubahan yang berlangsung tanpa batas

40. Dalam perkembangan, tumbuhan dari waktu ke waktu mengalami pertambahan volume dan ukuran. Proses tersebut disebabkan oleh …
a. bertambah banyaknya sel di dalam jaringan
b. bertambah besar dan bertambah banyaknya sel di dalam jaringan
c. pembesaran dan pemanjangan sel
d. bertambah panjangnya sel di dalam jaringan
e. penebalan dinding sel

41. Perkembangan pada makhluk hidup adalah suatu proses …
a. menuju pertumbuhan sekunder
b. pertambahan volume
c. perubahan substansi
d. pertambahan jumlah sel
e. menuju kedewasaan

42. Faktor-faktor eksternal yang memengaruhi pertumbuhan tumbuhan adalah …
a. temperatur, kelembapan, bibit unggul, tanah
b. kelembapan, cahaya, temperatur, genetis
c. cahaya, temperatur, kelembapan, hormon
d. air, kelembapan, temperatur, udara
e. hormon, air, kelembapan, tanah

43. Dalam perkecambahan, biji dipengaruhi oleh beberapa faktor. Faktor-faktor yang pada umumnya diperlukan untuk perkecambahan adalah …
a. oksigen, air, dan keadaan gelap
b. oksigen, temperatur yang hangat, dan air
c. oksigen, temperatur yang hangat, dan terang
d. oksigen, temperatur yang lembap, dan gelap
e. oksigen, sinar, dan karbonsioksida

44. Selain dapat menghambat pembelahan sel, etilen dapat membantu …
a. pengguguran daun
b. pematangan buah
c. pembelahan sel
d. dormansi pucuk
e. perbungaan

45. Pada tumbuhan yang ditanam di tempat gelap akan memiliki ciri sebagai berikut …
a. memiliki daun yang sempit
b. memiliki jaringan mesofil yang tebal
c. kloroplas yang cukup
d. transpirasi yang tinggi
e. tumbuh cepat, tetapi abnormal

46. Kecambah yang tumbuh di tempat gelap, batangnya lebih panjang daripada yang tumbuh di tempat terang. Oleh karena itu, muncul dugaan bahwa …
a. gelap adalah faktor pemacu pertumbuhan
b. cahaya memicu pertumbuhan
c. cahaya menimbulkan pembentukan racun
d. hormon mempercepat pertumbuhan batang
e. cahaya mempercepat pertumbuhan

47. Auksin yang dibentuk pada ujung kecambah akan dipengaruhi oleh cahaya. Apabila disinari pada satu sisi saja, kecambah tersebut akan …
a. tidak tumbuh
b. tumbuh lurus
c. tumbuh ke arah datangnya cahaya
d. tumbuh bengkok
e. tumbuh berlawanan dengan arah datangnya cahaya

48. Tepi daun yang menggulung pada suatu tumbuhan menandakan bahwa tumbuhan tersebut kekurangan unsur …
a. tembaga
b. mangan
c. besi
d. kalium
e. magnesium

49. Perbedaan antara temperatur siang dan malam dapat berpengaruh terhadap pertumbuhan tumbuhan. Respons tumbuhan terhadap pencahayaan tersebut dinamakan …
a. fotoperiodisme
b. long-day plant
c. short-day plant
d. neutral-day plant
e. termodinamika

50. Perkecambahan yang cotyledonnya muncul keaatas permukaan adalah ...
a. hypokotil
b. epicotyl
c. hypogeal
d. eppigeal
e. koleoptil  

KODOGEN TO KODON

• Transkripsi merupakan pembentukan/sintesis RNA dari salah satu rantai DNA, sehingga terjadi proses pemindahan informasi genetik dari DNA ke RNA. 
• Pemindahan kode geneteik dari Kodogen DNA ke Kodon m RNA
• Fungsi ini disebut fungsi heterokatalis DNA karena DNA mampu mensintesis senyawa lain yaitu RNA. 
• Sebuah rantai DNA digunakan untuk mencetak rantai tunggal mRNA dengan bantuan enzim polimerase. 
• Enzim tersebut menempel pada kodon permulaan, umumnya adalah kodon untuk asam amino metionin. 
• Pertama-tama, ikatan hidrogen di bagian DNA yang disalin terbuka. Akibatnya, dua utas DNA berpisah. 
• Salah satu polinukleotida berfungsi sebagai pencetak atau sense, yang lain sebagai gen atau antisense. 
• Misalnya pencetak memiliki urutan basa G-A-G-A-C-T, dan yang berfungsi sebagai gen memiliki urutan basa komplemen C-T-C-T-G-A. 
• Karena pencetaknya G-A-G-A-C-T, maka RNA hasil cetakannya C-U-C-U-G-A. Jadi, RNA C-U-C-U-G-A merupakan hasil kopian dari DNA C-T-C-T-G-A (gen), dan merupakan komplemen dari pencetak.
• Transkripsi DNA akan menghasilkan mRNA (messenger RNA). 
• Pada organisme eukariot, mRNA yang dihasilkan itu tidak langsung dapat berfungsi dalam sintesis polipeptida, sebab masih mengandung segmen-segmen yang tidak berfungsi yang disebut intron. 
• Sedangkan segmen-segmen yang berfungsi untuk sintesis protein disebut ekson. 
• Di dalam nukleus terjadi pematangan/pemasakan mRNA yaitu dengan jalan melepaskan segmen-segmen intron dan merangkaikan segmen-segmen ekson. 
• Gabungan segmen-segmen ekson membentuk satu rantai/utas mRNA yang mengandung sejumlah kodon untuk penyusunan polipeptida. 
• Rantai mRNA ini dikenal sebagai sistron.

Gb. Proses pematangan mRNA dengan membuang bagian  intron

• Proses transkripsi ini terjadi di dalam inti sel (nukleus). 
• DNA tetap berada di dalam nukleus, sedangkan hasil transkripsinya dikeluarkan dari nukleus menuju sitoplasma dan melekat pada ribosom. 
• Ini dimaksudkan agar gen asli tetap terlindung, sementara hasil kopinya ditugaskan untuk melaksanakan pesan-pesan yang dikandungnya. 
• Jika RNA rusak, akan segera diganti dengan hasil kopian yang baru

Transkripsi pemindahan kode genetik DNA ke RNA m ini melalui tiga langkah yaitu 

1.   Inisiasi (permulaan)

• Daerah DNA di mana RNA polimerase melekat dan mengawali transkripsi disebut sebagai promoter. Suatu promoter menentukan di mana transkripsi dimulai, juga menentukan yang mana dari kedua untai heliks DNA yang digunakan sebagai cetakan.

2.   Elongasi (pemanjangan)

• Saat RNA bergerak di sepanjang DNA, RNA membuka untaian heliks ganda DNA dengan bantuan enzim polimerase, sehingga terbentuklah molekul RNA yang akan lepas dari cetakan DNA-nya.

3.  Terminasi (pengakhiran)

• Transkripsi berlangsung sampai RNA polimerase mentranskripsi urutan DNA yang disebut terminator. Terminator yang ditranskripsi merupakan suatu urutan RNA yang berfungsi sebagai kodon terminasi (kode stop) yang sesungguhnya. Pada sel prokariotik, transkripsi biasanya berhenti tepat pada akhir kodon terminasi, yaitu ketika polimerase mencapai titik terminasi sambil melepas RNA dan DNA. Sebaliknya, pada sel eukariotik polimerase terus melewati sinyal terminasi, suatu urutan AAUAAA di dalam mRNA. Pada titik yang jauh kira-kira 10 hingga 35 nukleotida, mRNA ini dipotong hingga terlepas dari enzim tersebut.

DETAIL TRANSKRIPSI SEL PROKARYOTIK DAN EUKARYOTIK

• Selain mekanisme dasar yg hampir sama, pada eukariot dan prokariot keduanya memiliki prinsip sama pada proses transkripsinya:
• Prekursor untuk sintesis RNA ada 4 macam: 5′-trifosfat 

1. ATP
2. GTP
3. CTP
4. UTP ( g ada thymine pada RNA)

• Reaksi polimerisasi atau pemanjangan RNA sama dengan replikasi DNA yaitu dengan arah 5′ -> 3′ (5 ' ke 3')\
• Urutan nukleotida RNA hasil sintesis ditentukan oleh urutan DNA template ( Dna Sense)
• Untai DNA yang berperan sebagai cetakan hanya salah satu untai
• Dan produk hasil transkripsi berupa RNA untai tunggal

Transkripsi pada Prokariot

• Salah satu ciri dari prokariot adalah adanya struktur operon. 
• Operon adalah organisasi dari beberapa gen yang ekspresinya dikendalikan oleh satu promotor. 
• Misal operon lac, pada metabolisme laktosa pada bakteri E.coli. 
• Pada waktu ditranskripsi operon lac akan menghasilkan satu mRNA yang membawa kode2 genetik untuk polipeptida berbeda yang disebut dengan mRNA polisistronik.

• Sesuai gambar di atas, pada operon lac punya 3 gen struktural yaitu lac Z, lac Y dan lac A. 
• Lac lac ini secara umum untuk proses metabolisme lactosa sendiri ( membentuk energi ) secara detail terdiri dari Transferase , galaktosidase dan Permease. Nama -nama itu berarti transfer: membentuk suatu protein yang berperan mentranslokasikan laktosa ke dalam sel, galaktosidase itu adalah suatu kelas enzim untuk memecah laktosa yang ada di dalam sel, dsb....
• Masing2 dari gen itu punya start codon dan stop codon sendiri2 namun ekspresinya tetep dikendalikan  oleh operon yg sama. 
• Kemudian waktu ditranskripsi hasilnya 1 mRNA yg membawa kodon kodon 
• Yang kodon itu membentuk 3 macam polipeptida yg beda. 
• Setelah itu dilanjutkan dengan translasinya 
• Prosesnya bagaimana ? nanti yanng pasti akan jadi 3 polipeptida yang independen 

Struktur Gen Prokariot

• Pada prokariot gennya secara umum tersusun atas promotor, bagian struktural, dan terminator

Promotor

• Promotor adalah urutan DNA spesifik yang berperan dalam mengendalaikan transkripsi gen struktural dan terletak di daerah upstream (hulu) dari bagian struktural gen.
• Fungsi promotor? 
• Sebagai tempat awal pelekatan enzim RNA polimerase yang nantinya melakukan transkripsi pada bagian struktural
• Pada prokariot bagian penting promotornya disebut sebagai Pribnow box pada urutan nukleotida -10 dan -35. 
• Biasanya berupa TATA box.

Apa fungsi dari pribnow box? 

• Pribnow box merupakan daerah tempat pembukaan heliks DNA untuk membentuk kompleks promotor terbuka. 
• Jadi di TATA box itulah DNA dipisahkan dan kalau di luar TATA box helix DNA nya tetep berikatan
• Intinya tatabox berfungsi sebagai sekuens agar trankripsi dimulai pada lokasi yang spesifik yakni melalui bantuan sigma factor....

Operator

• Operator merupakan urutan nukelotida yang terletak di antara promotor dan bagian struktural dan merupakan tempat pelekatan protein represor (penekan atau penghambat ekspresi gen). 
• Jika ada represor yang melekat di operator maka RNA polimerase g bisa jalan trus ekspresi gen tidak bisa berlangsung.
• Pada gambar di atas operator disimbolkan dengan warna ungu yg berada di antara promotor (merah) dan structural gene (hijau).
• Selain adanya supresor ada juga yg namanya enhancer. 
• Supresor untuk menghambat 
• Enhancer kebalikannya, Enhancer justru meningkatkan transkripsi dengan meningkatkan jumlah RNA polimerase. 
• Namun letaknya tidak pada lokasi yang spesifik seperti operator
• Ada yang jauh di upstreamatau bahkan downstream dari titik awal transkripsi.

Coding Region

• Gen struktural merupakan bagian yang mengkode urutan nukleotida RNA. 
• Transkripsi dimulai dari sekuens inisiasi transkripsi (ATG) sampai kodon stop (TAA / TGA / TAG).
• Pada prokariot tidak ada sekuens intron (yg tidak dapat diekspresikan) sehingga semuanya berupa ekson. 
• Namun kadang pada archaebacteria dan bakteriofag ada yg memiliki intron.

Terminator

• Dicirkan dengan struktur jepit rambut / hairpin dan lengkungan yang kaya yang akan urutan GC yang terbentuk pada molekul RNA hasil transkripsi.

RNA Polimerase

• RNA polimerase merupakan enzim yang mengkatalisis proses transkripsi. 
• Jika susunannya lengkap misalnya α₂ββ’σ disebut holoenzim. 
• Sedang jika g ada σ cuma α₂ββ’ disebut core-enzyme.

Fungsi subunit2 itu:

α = diduga berfungsi dalam penyusunan enzim

β = berfungsi dalam pengikatan nukleotida

β’ = berfungsi dalam penempelan DNA

σ = berfungsi untuk mengarahkan agar RNA polimerase menempel pada promotor.

Mekanisme Transkripsi

Inisiasi

• Pembentukan kompleks promoter tertutup
• RNA polimerase menuju ke promoter atas bantuan faktor σ. 
• Jika diibaratkan pesawat, sigma itu antenanya
• Kemudian promotor itu bandaranya. Kan pesawat selalu mendarat di bandara, dibantu ama signal.

Pembentukan kompleks promoter terbuka

• Bagian DNA yang berikatan dengan RNA polimerase membentuk struktur gelembung transkripsi (transcription bubble) yang stabil.
• Penggabungan beberapa nukleotida awal
• Dalam transkripsi nukleotida RNA digabung hingga membentuk transkrip RNA. 
• Awal nya  basa2 RNA yang digabung membentuk ikatan hidrogen dengan basa DNA cetakan
• Pelepasan subunit σ dan perubahan konformasi holoenzim jadi core enzyme
• Setelah inisiasi terjadi, subunit σ terlepas dari enzim inti dan dapat digunakan oleh enzim inti RNA polimerase lain.

Elongasi

• Dalam elongasi, nukleotida ditambahkan secara kovalen pada ujung 3′ molekul RNA yg baru terbentuk (RNA baru terbentuk dgn arah 5′ -> 3′) yang menggunakan ikatan fosfodiester. 
• Nukleotida RNA yg ditambahkan bersifat komplementer dgn nukleotida untai DNA cetakan.

Terminasi

Penghentian transkripsi atau terminator ada 2:

1. Rho-independent
2. Rho-dependent

Rho-independent 

• Yaitu terminasi ditentukan urutan nukleotida.  
• DIcirikan struktur jepit rambut / hairpin yang kaya akan basa GC. 
• Mekanisme pemisahan? 
• Akibat struktur itu, RNA polimerase ntr berhenti dan meruka bagian dari sambungan (hibrid) DNA-RNA.
• Kemudian sisa hibridnya merupakan urutan oligo U (rU) yg tidak cukup stabil berpasangan dengan A (dA) -> ikatan hidrogen cuma 2. 
• Akibatnya Lepasnya ikatan lemah tersebut dan RNA hasil transkripsi lepas 

Rho-dependent 

• yaitu terminasi memerlukan protein rho. 
• Faktor rho terikat pada RNA transkrip kemudian ngikut RNA polimerase sampe ke daerah terminator. 
• Kemudian faktor rho membuat destabilisasi ikatan RNA-DNA hingga RNA terlepas

Transkripsi pada Eukariot

Struktur gen

• Secara umum hampir sama ama prokariot ada promotor, bagian struktural dan terminator. Yg beda pada bagian strukturalnya

Bagian struktural pada eukariot

• Kenapa bagian struktural/coding region nya beda? 
• karena jika pada sel eukariot ada bagian intron dan ekson.

Intron (intervening sequences) 

• Merupakan sekuens yg tidak mengkode asam amino. 
• Jika pada gambar yang warnanya biru muda agak hijau 
• Bagian ini akan dibuang saat pematangan RNA . OK

Ekson 

• Sekuens yg nantinya dikode jd asam amino. 
• Pada gambar warnanya merah

Mekanisme Transkripsi

• Pada sel eukariot RNA polimerasenya beda2 ada RNA polimerase I, II dan III. 
• Dan penggunaannya dalam sintesis molekul beda.
• Sebelum RNA polimerase nempel di promotor, ada faktor transkripsi yang bantu ng-guide si RNA polimerase. 
• Jika pada RNA polimerase I guidenya SL1 dan UBF
• Pada RNA polimerase II dibantu ama TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF, TFIIH dan TFIIJ (banyak banget ==”).
• Sedang RNA polimerase III dipandu ama TFIIIA, TFIIIB, TFIIIC ama protein TBP.
• Faktor TBP merupakan protein yang diperlukan jika gen2 g punya TATA box.
• Kemudian setelah si RNA polimerase dibantu oleh faktor transkripsi (TF) ke TATA box baru terjadi proses elongasi dan berhenti sampai ketemu terminator. OK

Proses pasca-transkripsi

• Dengan adanya intron pada eukariot, makanya mRNA yg dihasilkan g bisa langsung dikeluarin ke sitosol untuk ditranslasi namun harus diolah dulu. 

Caranya terus bagaimana ?

1. Splicing
2. poly\iadeilasi
3. Capping

Splicing

• Merupakan proses pembuangan intron dan penyambungan ekson. 
• Awalnya RNA hasil transkripsi pd eukariot disebut pre-mRNA karena masih ada intronnya. 
• kemudian intron akan dipotong dan ekson2 disambung menjadi mRNA matang (mature mRNA).  
• Intron dipotong pake spliceosome. lalu penyambungan ekson2 menggunakan enzim ligase.

Poliadenilasi

• Merupakan proses penambahan poliA (rantai AMP) pada ujung 3′ nukleotida mRNA. 
• Fungsinya? untuk meningkatkan stabilitas mRNA dan meningkatkan efisiensi translasinya.

Capping

• Penambahan tudung mRNA berupa molekul 7-metilguanosin. 

Fungsinya Capping adalah :

1. Melindungi mRNA dari degradasi
2. Meningkatkan efisiensi translasi mRNA
3. Meningkatkan pengangkutan mRNA dari nukelus ke sitoplasma
4. Meningkatkan efisiensi proses splicing\