BIOLOGI GONZAGA

Sunday, November 8, 2020

HEREDITAS - GENETIKA - MENDEL

HEREDITAS

MENDEL

MONOHIBRID

DIHIBRID

Test Cross Trihibrid

Allela Ganda - Golongan Darah dan Bulu Kelinci

Pada Lokus terdapat Lebih dari satu yang memberikan karakter sehinnga bisa membentuk lebih dari satu Allela IAIA, IAIO, IBIB,IBIO,IAIB,IOIO - C>Cch>Ch>c

CONTOH PERKAWINAN NORMAL

CONTOH PERKAWINAN GEN LINKAGE

KASUS PEMBENTUKAN GAMET TERJADI CROSSING OVER

Jika AABB X aabb maka hasilnya Linkage maupun Crossing Over AaBb

Ketika AaBb keturunan F1 terjadi Crossing Over seperti diatas maka terbentuk 4 macam Gamet OK

Jadi Crossing Over memunculkan Varian Gamet AB,Ab,aB, ab

Tanpa Crossing Over

Jika AABB X aabb maka hasilnya Linkage maupun Crossing Over AaBb

Ketika AaBb keturunan F1 terjadi Tidak Crossing Over seperti diatas maka terbentuk 2 macam Gamet

Jadi Tanpa Crossing Over memunculkan Varian Gamet AB dan ab

Contoh soal:

Hasil persilangan antara mangga besar manis (BbMm) dengan mangga kecil asam (bbmm) memperoleh hasil sebagai berikut:
Besar asam = 150
Besar manis = 750
Kecil manis = 100
Kecil asam = 500
Tentukan nilai pindah silangnya?

Contoh soal diatas terjadi Crossing Over Karena terbentuk Varian dengan munculnya Jenis Besar Asam 150 dan Jenis Kecil manis 100

MakaTerlihat jika

Hasil persilangan antara mangga besar manis (BbMm) dengan mangga kecil asam (bbmm) memperoleh hasil sebagai berikut:

Besar asam = 150

Besar manis = 750

Kecil manis = 100

Kecil asam = 500

Tentukan nilai pindah silangnya?

Maka Varian yang muncul ( Rekombinansi atau Nilai Pindah silang = Yang aneh / total X 1005

250/ 1500 x 1005 = 16,67 %

SOAL BARU

Jika Besar Manis hasil keturunan terjadi Crossing Over 30 % maka Genotif yang mengalami Linkage 70% dan yang Crossing Over 30 %

Maka Hitungannya

Gamet yang Linkage 70 % maka AB = 35 % Ab = 0% aB = 0 % dan ab = 35%

Jika yang Crossong Over 30 % maka

Terbentuk Varian sebanyak 4 Gamet yaitu = AB, Ab,aB,ab karena hanya 390% maka masing masing Gamet nya

AB = 7.5% , Ab = 7,5 % , aB = 7,5% dan ab = 7,5%

Jadi

Gamet AB keseluruan Yang terbentuk = 35 %+ 7.5 % = 42,5%
Gamet ab keseluruan Yang terbentuk = 35 %+ 7.5 % = 42,5%
Gamet Ab keseluruan Yang terbentuk = 7,5%
Gamet aB keseluruan Yang terbentuk = 7,5%

NON DISJUNGTION - GAGAL BERPISAH

Kasus ini muncul karena proses gametogenesis ketika Anafase gagal memisahkan Kromosom daro Equator ke Kutub ( Anafase Lag) sehingga ada kromosom pada sel gamet tidak sama kromosomnya seharusnya sama dapat n atau dimanusia 23 kromodom masing masing salah satu dapat 22 dan satunya dapat 24 OK

Oogenesis pada lalat Drosophylla betina mengalami non Disjungtion maka terbentuk gamet yang X, XX dan 0 tanpa gonosom . Jika lalat jantan spermatogenesis maka hasilnya demikian seperti pada tabel

DETERMINASI SEX - iDENTIFIKASI JEIS KELAMIN

Untuk Determinasi sex akibat Gagal Berpisah terlihat sebagai berikut

Gen Lethal

Mati dalam Genotif yang Homozygote

Youtube HEREDITAS

Untuk lebih Jelasnya

Friday, November 6, 2020

STE

STE- Fosforilisasi Oksidatif

Tahapan kunci dari proses-proses ini adalah sebagai berikut:

Pengiriman elektron oleh NADH dan FADH2.
Keduanya adalah molekul pembawa elektron hasil oksidasi proses glikolisis maupun siklus Krebs.
Pada rantai transpor elektron, keduanya menyumbangkan elektron ke mekanisme rantai transpor elektron dan akan diubah kembali menjadi NADH+ dan FAD yang bisa digunakan kembali pada proses oksidasi berikutnya.

Transfer elektron dan pompa proton.

Elektron yang disumbangkan NADH dan FADH2 berupa elektron berenergi tinggi akan dipindahkan dari satu kompleks protein ke kompleks protein lain di membran dalam mitokondria.
Sambil bergerak, elektron ini akan melepaaskan energi.
Energi yang dilepaskan digunakan untuk memompa proton atau ion hidrogen (H+) dari matriks ke ruang intermembran mitokondria.
Proses ini menciptakan gradien elektrokimia.

SITUASI HIRUK PIKUK CRISTAE MITOCHONDRIA

Pembelahan oksigen membentuk air.

Setelah melewati berbagai protein, pada akhirnya elektron yang dipindahkan mengalami penuurnan tingkat energi.
Di tahap akhir, elektron ini kemudian dipindahkan ke akseptor elektron terakhir yaitu berupa molekul oksigen (O2).
Setelah menerima elektron, O2 terpecah menjadi dua dan masing-masing akan menghasilan molekul air (H2O). OK

Sintesis ATP.

Proses sebelumnya menciptakan gradien elektrokimia H+ antara matriks dengan ruang intermembran.
H+ ini kemudian akan dialirkan kembali ke matriks dan proses pengaliran ini kemudian dimanfaatkan untuk mensinesis molekul ATP. OK (lihat gambar atas)

Struktur dan Fungsi Mitokondria

Untuk memahami konteks transpor elektron dan fosforilisasi oksidatif tidak bisa lepas dari pengetahuan mengenai struktur unik dari mitokondria.

Mitokondria adalah organel sel yang khusus bertugas memproduksi energi.
Organel ini menempati secara substansial volume sitoplasma sel eukariota.

Ringkasan cara mitokondria memproduksi energi berupa ATP

Peranannya mitokondria dalam produksi energi pada eukariota sangat penting.

Tanpa organel ini, makhluk hidup akan hanya menggantungkan produksi energinya dari proses glikolisis secara anaerob.
Bentuk mitokondria sendiri umunya berupa silinder panjang dengan diameter 0,5 – 1 µm menyerupai bakteri.
Di dalam sel, organel ini bergerak cukup aktif dan bisa berubah bentuk secara fleksibel.
Kini study Mitochondria menjadi mengglobal dibanding Nukleus Karena Power House ini penting bagi sel , Sel kanker sangat memerlukan ini untuk membelah tanpa batas dan cepat maka organela ini harus dipelajari untuk menyetop sel Kanker yang berbahaya itu OK

Struktur Membran Ganda Mitokondria

Lapisan membran ganda pada mitokondria berarti terdapat membran dalam dan membran luar.
Membran luar berbatasan langsung dengan sitoplasma, ruangan antara membran luar dan membran dalam disebut ruang intermembran, sedangkan ruangan yang dilingkupi membran dalam dinamakan matriks mitokondria.

Louisa Howard dan Kelvinsong – Wikipedia modifikasi.

Struktur umum mitokondria. Kiri gambar dari elektron mikroskop dan gambar kanan susunan secara skematik,

Membran luar dari mitokondria ini mengandung banyak molekul porin.
Porin ini berfungsi sebagai protein transfor dengan membentuk kanal air yang besar. Molekul dengan besar 5000 Da atau kurang dapat bergerak bebas menembus membran luar ini.
Sebaliknya, membran dalam memiliki sifat impermeabel. Oleh sebab itu, ruang intermembran memilki konstitusi yang mirip dengan sitoplasma.

Dari gambar tersebut, tampak pula bagian membran dalam yang melipat yang disebut cristae.
Bentuk tersebut bermanfaat untuk memaksimalkan efek dari transpor elektron. Berikut bagan yang memperlihatkan fungsi dari cristae tersebut:

Bentuk cristae mitokondria dengan fungsi rantai transpor elektron

Peran Unik Membran Dalam dan Matriks Mitokondria

Fungsi utama dari produksi energi mitokondria terutama dijalankan oleh membran dalam dan matriks dari mitokondria.
Hal ini berkaitan dengan struktur membran dalam yang terspesialisasi.
Membran dalam ini terdiri dari lipid bilayer yang mengandung jenis fosfolipid cardiolipin dalam proporsi besar.
Kandungan ini membuat membran dalam mitokondria impermeabel atau tidak dapat ditembus terutama oleh berbagai macam ion.

Struktur molekul cardiolipin. Membran dalam mitokondria mengandung proporsi cardiolipin yang besar.

Membran dalam dari mitokondria juga mengandung berbagai jenis protein yang membuat membran ini permeabel secara selektif terhadap molekul kecil yang dimetabolisme atau diperlukan oleh banyak enzim mitokondria yang terkonsenterasi di dalam matriks.

Enzim dalam matriks ini seperti enzim yang terlibat dalam proses metabolisme piruvat dan asam lemak untuk menghasilkan asetil-CoA dan juga yang dibutuhkan dalam proses oksidasi asetil-CoA pada siklus Krebs.

Seperti pada gambar di atas, membran dalam mitokondria berkelok-kelok membentuk lipatan yang dinamakan cristae.
Lipatan ini menambah besar luas permukaan membran dalam mitokondria.untuk pengikatan Oksigen dibantu enzim sitokrom

Materi Genetik dan Biosintesis dalam Mitokondria

Kenapa mitokondria memiliki sistem genetik terpisah?

Berbeda dari organel lainnya, mitokondria adalah satu-satunya organel, selain inti sel dan Chloroplast yang memiliki DNA di dalamnya.
Untuk menjawab pertanyaan tersebut bukanlah hal yang mudah.
Walaupun memiliki DNA tersendiri, ternyata kurang lebih 90 protein tambahan harus diimpor dari inti sel.
Oleh sebab itu, untuk menjalankan fungsinya, proses biosintesis pada mitokondria memerlukan kontribusi dari dua sistem genetik yang berbeda yaitu dari inti sel dan dari mitokondria sendiri.

Asal protein dan RNA dari mitokondria, memerlukan koordinasi dari inti sel dan dari mitokondria sendiri

Protein yang diimpor ini terutama protein ribosomal, aminoacyl-tRNA synthase, DNA polimerase, RNA polimerase, dan enzim yang terlibat dalam pemrosesan dan modifikasi dari RNA.
Untuk mendatangkan protein ini ternyata tidak mudah dan menyulitkan menjawab pertanyaan kenapa mitokondria memiliki DNA tersendiri.

DNA Mitokondria Manusia

Adapun DNA dari mitokondria manusia bentuk sirkuler yang terdiri dari 16.569 nukleotida.
Sebenarnya dibandingkan dengan besarnya DNA makhluk hidup lain, DNA mitokondria manusia termasuk berukuran kecil.

Genom mitokondria manusia

Perbandingan genom DNA mitokondria manusia dengan beberapa makhluk lain

Terdapat beberapa sifat unik dari DNA mitokondria manusia dibandingkan DNA di inti sel, kloroplas, ataupun genom bakter, sebagai berikut:

Paket gen yang padat.
Tidak seperti genom di inti sel, setiap nukleotida di mitokondria manusia dikodekan dan masuk dalam sekuens gen baik untuk protein maupun satu dari rRNA atau tRNA.
Dikarenakan posisi yang padat satu sama lain, hanya sedikit ruang yang dapat digunakan untuk regulasi sekuens DNA

Penggunaan kodon yang relatif relaks.

Biasanya terdapat 30 atau lebih tRNA untuk asam amino yang spesifik namun di mitokondria hanya ada 22 tRNA yang dibutuhkan dalam sintesis protein.
Oleh sebab itu di mitokondria, pasangan kodon-antikodon tidak seperti di inti sel.

Variasi kode genetik.

Di mitokondria terdapat kode genetik yang sedikit berbeda.
Empat dari 64 kodon memiliki arti yang berbeda dibandingkan pada DNA di inti sel.

NADH dan FADH2 Sebagai Molekul Sumber Elektron Berenergi Tinggi

NADH dan FADH2 yang dihasilkan oleh glikolisis dan siklus Krebs merupakan molekul sumber elektron berenergi tinggi. Elektron berenergi tinggi kemudian akan ditransfer ke membran dalam mitokondria untuk dipanen energinya dan akhirnya menghasilkan ATP. NADH dan FADH2 yang kehilangan elektron berenergi tinggi akan berubah menjadi NADH+ dan FAD yang kemudian digunakan kembali di glikolisis dan siklus Krebs untuk kembali menjadi NADH dan FADH2.

Cara NADH membawa dan memberikan elektron berenergi tinggi

Setelah elektron berenergi tinggi dipindahkan ke membran dalam mitokondria, maka energi pada elektron ini akan diambil dan dimanfaatkan untuk memompa ion hidrogen keluar dari matriks. Ion hidrogen ini kemudian akan dialirkan kembali ke dalam matriks sambil diubah menjadi ATP.

Perubahan energi potensial redoks elektron menjadi energi bebas setiap terjadi perpindahan elektron dalam rantai transpor elektron

Rangkaian Proses Rantai Transpor Elektron

Rantai transpor elektron melepas begitu banyak energi.
Energi ini didapat dari proses reaksi redoks dimana secara agregat terjadi perpindahan dari elektron dari molekul dengan affinitas elektron lemah yaitu NADH sampai ke oksigen yang merupakan molekul dengan affinitias elektron tinggi.
Secara umum dalam proses ini setiap perpindahan elektron melepas energi bebas (ΔG°) sebesar -26,2 kkal/mol (110 kJ/mol).
Besarnya energi ini tidak dilepas langsung melalui satu proses saja.
Apabila hal ini terjadi hanya dengan satu langkah, maka proses yang terjadi akan seperti ledakan dan semua energi yang dilepas akan berupa panas.
Hal ini tentu tidak menguntungkan dan malah akan sangat berbahaya.
Oleh sebab itu, reaksi pelepasan energi ini dilakukan dengan proses bertahap sehingga dinamakan rantai transpor elektron.

Mari kita bahas secara lebih detil mengenai tahapan-tahapan reaksi transpor elektron ini.

Molekul Karier Elektron dalam Rantai Pernapasan

Dalam proses rantai elektron, elektron dibawa oleh molekul yang dinamakan karier elektron.
Salah satu kelompik karier elektron ini berupa molekul yang bersifat dapat menyerap cahaya dan berubah warnanya ketika mengalami reduksi atau oksidasi.
Oleh karena sifatnya ini, maka molekul karier elektron tersebut diberi nama sitokrom.

Dari penelitian, ternyata molekul sitokrom ini memiliki banyak jenis.

Setidaknya ada tiga kelompol sitokrom yaitu sitokrom a, b, dan c.
Dalam setiap sel dapat memiliki lebih dari satu jenis sitokrom.
Adapun struktur dari sitokrom ini berupa protein yang berikatan dengan grup heme yang memiliki ion besi di tengahnya.
Ion besi di grup heme ini dapat berubah dari bentuk ferri (Fe3+) ke bentuk ferro (Fe2+) saat menerima elektron.

Grup heme sendiri berupa cincin forfirin yang mengelilingi atom ion besi.
Besi diikat dalam cincin forfirin ini oleh empat atom hidrogen membentuk empat sudur segi empat.

Struktur heme pada sitokrom.

Selain sitokrom, molekul lain dengan inti besi sulfat juga berfungsi sebagai karier elektron dalam rantai oksidasi pernapasan.

Sistem karier elektron dengan inti besi sulfat.

(A ) Inti dengan tipe 2Fe2S.
(B) Inti dengan tipe 4Fe4S.
Walaupun memiliki banyak atom besi, namun setiap inti hanya bisa membawa satu elektron.
Pada rantai pernapasan, terdapat setidaknya tujuh molekul karier elektron dengan inti besi-sulfat.

Quinone (nama lain ubiquinone atau koenzim-Q) adalah molekul non protein dan merupakan bentuk paling sederhana dari karier elektron.
Molekul ini merupakan molekul hidrofobik kecil yang bisa bergerak bebas di tengah lapisan membran dalam lipid bilayer dari mitokondria.
Quinone dapat mengambil atau memberi satu atau dua elektron dan dapat disertai mengambil satu proton untuk setiap elektron yang dibawanya.

Struktur molekul quinone.

Pada rantai pernapasan quinone mengambil satu proton dari lingkungan air disekitarnya untuk setiap elektron yang diterima.

Molekul ini dapat membawa satu atau dua elektron.
Ketika ubiquinone melepas elektron, ion hidrogen juga dilepas.

Rantai Transpor Elektron Melibatkan Tiga Kompleks Enzim yang Tertanam di Dalam Membran Dalam Mitokondria

Rantai transpor elektron melibatkan tiga kompleks besar dari enzim. Kompleks enzim ini tertanam di membran dalam mitokondria dan terlibat dalam perpindahan elektron dari NADH hingga akhirnya sampai ke oksigen.

Skema perpindahan elektron dan tiga komplek enzim dalam rantai transpor elektron.

Selain memindahkan elektron, ketiga kompleks enzim ini juga memiliki kemampuan memompa proton. Di membran dalam mitokondria, tiga kompleks enzim ini berorientasi secara asimetris dan memompa ion hidrogen dari matriks ke ruangan intermembran mitokondria. Berikut adalah keterangan mengenai ketiga kompleks enzim tersebut:
Kompleks NADH hidrogenase (secara umum dikenal sebagai kompleks I atau NADH-CoQ reductase complex). Kompleks ini merupakan kompleks terbesar yang mengandung lebih dari 40 rantai polipeptida. Kompleks ini menerima elektron dari NADH dan memindahkannya ke ubiquinone melalui flavin dan setidaknya tujuh inti besi-sulfat. Ubiquinone kemudian mengirimkan elektron ini ke kompleks yang kedua dari rantai transpor elektron yaitu kompleks sitokrom b-c1.
Kompleks sitokrom b-c1 (dikenal sebagai kompleks III atau CoQH2—cytochrome c reductase complex). Kompleks ini mengandung setidaknya 11 rantai polipeptida dan berfungsi sebagai sebuah dimer. Tiap monomer mengandung tiga heme yang terikat ke sitokrom dan protein besi-sulfat. Kompleks ini menerima elektron dari ubiquinonen dan menyerangkannya ke sitokrom c yang membawa elektron ke kompleks sitokrom oksidase.
Kompleks sitokrom oksidase (kompleks IV atau cytochrome c oxidase complex), berfungsi juga sebagai dimer dengan setiap monomer memiliki 13 rantai polipeptida, termasuk dua sitokrom dan dua atom tembaga. Kompleks ini menerima elektron satu per satu dari sitokrom c dan kemudian menyerahkan elektron tersebut, empat elektron sekaligus ke atom oksigen.

Reaksi empat elektron dengan oksigen pada kompleks sitokrom oksidase

Sitokrom, inti besi-sulfat, dan atom tembaga hanya dapat menerima satu elektron tiap waktu namun NADH mendonasikan dua elektron dan tiap oksigen menerima empat elektron sekaligus. Oleh sebab itu terdapat sistem yang menampung elektrn pada rantai transpor elektron ini yang salah satu sistem tersebut adala sitokrom oksidase.

Struktur sitokrom oksidase. (A) Struktur molekul kompleks enzim secara keseluruhan (B) Karier elektron berada di subunit I dan II sesuai indikasi warna
Succinate-CoQ Reductase Complex

Pada siklus Krebs tahap 6 terjadi reaksi perubahan oksidasi suksinat menjadi fumarat dengan mengghasilkan FADH2. Sebenarnya enzim yang memperantarai reaksi ini merupakan komponen dari rantai transpor elektron. Enzim ini berupa kompleks II dari rantai transpor elektron atau succinate-CoQ reductase complex. Perhatikan bagan di bawah ini:

Kompleks enzim rantai transpor elektron termasuk kompleks II, succinate-CoQ reductase complex. Modifikasi dari “Oxidative phosphorylation: Figure 1“, oleh OpenStax College, Biology (CC BY 3.0).

Perbedaan dari kompleks I adalah bahwa kompleks II menerima elektron berenergi tinggi dari FADH2 dan kompleks Ii tidak memiliki sifat pompa proton. Oleh sebab itu, proses penerimaan elektron berenergi tinggi dari FADH2 menghasilkan lebih sedikit ATP dibandingkan dari NADH.

Perbandingan rantai transpor elekron antara dari kompleks I dan kompleks II. Perhatikan bahwa kompleks II tidak memiliki aktivitas pompa proton.
Electron Tunneling pada Rantai Transpor Elektron

Salah satu fenomena mekanika atau fisika kuantum berupa electron tunneling pada sel dapat diobservasi pada rantai transpor elektron. Hal ini terjadi saat terjadi perpindahan elektron antara karier elektron dengan kompleks enzim.

Peristiwa perpindahan elektron ini terjadi secara kolisi atau tumbukan secara acak atau random. Pada perhitungan, dalam situasi ini terjadi tumbukan dan perpindahan elektron dalam setia 5-20 milidetik.

Hal unik dalam perpindahan elektron ini bahwa tidak hanya terjadi saat tumbukan namun dapat pula dengan aproksimasi atau kedekatan dua karier dengan celah sampai sejauh 2 nm. Bagaimana elektron dapat melompati celah ini? Jawabannya adalah dengan mekanisme quantum tunneling.
Uncoupler pada Rantai Transpor Elektron

Dalam kondisi tertentu, dapat terjadi proses rantai transpor elektron tanpa menghasilkan ATP. Peristiwa ini dinamakan uncoupling dan terjadi dengan adanya zat yang dinamakan uncoupler. Uncoupler ini dapat berupa zat sintetis seperti dinitofenol dan dapat pula berupa uncoupler alami.

Contoh peristiwa ini adalah pada jaringan lemak coklat. Jaringan ini berfungsi menjaga suhu dengan membakar lemak dan berperan penting dalam menjaga suhu terutama pada bayi tanpa perlu proses produksi panas dari menggigil.

Kita ketahui salah satu produksi panas tubuh adalah dari proses menggigil. Namun bayi belum mampu melakukan ini sehingga memerlukan proses lain. Proses produksi panas ini berlangsung di jaringan lemak coklat.

Dengan proses uncoupling, rantai transpor elektron dapat terjadi secara cepat tanpa memproduksi ATP dan gradien elektrokimia. Proses ini memungkinkan mitokondria membakar sebanyak mungkin lemak dan memproduksi panas bagi tubuh. Adapun uncoupler pada jaringan ini berupa protein yang dapat menghilangkan gradien elektrokimia.
Inhibisi Rantai Transpor Elektron

Salah satu mekanisme racun adalah menghambat rantai transpor elektron. Salah satunya adalah sianida yang menghambat kerja kompleks sitoktom okasidae dari rantai transpor elektron. Berikut adalah beberapa zat yang dapat menghambat rantai transpor elektron:

Inhibitor rantai transpor elekton. Complex I, NADH: ubiquinone oxidoreductase; complex II, succinate: ubiquinone oxidoreductase; complex III, ubiquinol: ferricytochrome c oxidoreductase; complex IV, ferrocytochrome c: oxygen oxidoreductase
Kemiosmosis

Akibat adanya rantai transpor elektron, tercipta perbedaan konsenterasi ion hidrogen antara matriks dengan ruangan intermembran mitokondria. Perbedaan konsensterasi ini menciptakan gradien elektrokimia proton yang terdiri dua komponen. Yang pertama adalah gradien atau perbedaan energi potensial listrik membran (ΔV) dan yang kedua adalah gradien pH (ΔpH). Kedua jenis gradien ini, terutama ΔV menyumbangkan gaya utama yang nanti akan digunakan oleh mitokondria dalam memproduksi ATP pada proses kemiosmosis.

Dua komponen gradien elektrokimia di mitokondria. Gradien potensial membran memberi proporsi gaya lebih besar dibandingkan gradien pH
Gradien Elektrokimia Proton Mendorong Sintesis ATP

Perbedaan gradien elektrokimia yang disebutkan di atas akan menjadi sumber energi sintesis ATP. Konversi energi elektrokimia menjadi ATP ini dilakukan oleh enzim di membran dalam mitokondria yang bernama ATP sintase. Pada dasarnya enzim ini membentuk terowongan atau kanal ion hidrogen di membran dalam mitokondria. Akibat gradien elektrokimia tadi, maka ion hidrogen akan melintas kanal melewati ATP-sintase. Ketika melintas maka energi kinetik dari ion hidrogen akan dipakai untuk menggabungkan ADP dengan Pi membentuk ATP.

Gradien elektrokimia yang dihasilkan rantai transpor elektron digunakan dalam sintesis ATP
Struktur Kompleks Enzim ATP-Sintase

Di bawah adalah gambar struktur dari enzim ATP-sintase atau disebut juga F0F1 ATP-sintase. Enzim ini berupa kompleks multiunit protein dengan berat 500.000 dalton dan bekerja dengan mekanisme katalis rotorik. Bagian besar yang menyerupai lolipop terdiri dari enam subunit dan menonjol ke matriks mitokondria.

Bagan struktur ATP-sintase

Terdapat bagian yang berelongasi ke kepala lolipop dengan memegang kepala lolipop dan menyambungkannya ke protein transmembran membentuk stator di dalam membran. “Stator” di membran ini berkontak dengan “rotor” di dalam membran. Bagian rotor ini terbentuk dari 10-14 subunit protein transmembran yang identik.

Saat proton melewati saluran atau kanal sempit di tempat kontak antara rotor dan stator, pergerakan ini akan menyebabkan cincin rotor berputar. Perputaran ini juga menyebabkan tangkai yang terhubung ke rotor juga berputar sehingga kepala lolipop juga akan berputar. Akibatnya, terjadi perubahan gradien elektrokimia menjadi energi mekanik di enzim.

Tiga dari enam subunit di bagian kepala lolipop mengandung situs ikat terhadap ADP dan fosfat inorganik. Subunit ini bergerak untuk membentuk ATP dengan memanfaatkan energi kinetik menjadi energi kimia dengan serangkaian perubahan bentuk konformasi saat terjadi pergerakan bagian lolipop dari ATP-sintase. Dengan cara ini, ATP-sintase dapat memproduksi 100 ATP tiap detik dengan produksi 3 molekul ATP tiap satu putaran rotor ATP-sintase. Diperkirakan dibutuhkan 3 – 5 ion hidrogen untuk menghasilkan satu ATP.
ATP Sintase dapat Berdungsi Terbalik Memompa H+ dengan Energi dari Hidrolisis ATP

ATP sintase bersifat bolak balik. Artinya selain memproduksi ATP dari pergerakan H+, enzim dapat berfungsi sebaliknya memompa H+ dengan memanfaatkan energi dari hidrolisis ATP menjadi ADP. Istilah dari sifat yang bolak balik ini dinamakan reversible coupling device.

Sifat reversibel ATP-sintase. (A) ATP-sintase dalam proses sintesis ATP. (B) ATP-sintase menghidrolisis ATP untuk memompa ion hidrogen.

Selain di manusia, ATP-sintase juga dimiliki banyak makhluk hidup lain seperti bakteri. Pada bakeri sifat enzim sebagai reversible coupling device dimanfaatkan dalam transisi antara metabolisme aerob ke anaerob.
Hasil ATP dari Rantai Transpor Elektron

Seperti dijelaskan di atas, bahwa produksi ATP tergantung dari banyaknya ion hidrogen yang dialirkan.

Dari rantai transpor elektron, NADH akan mengeluarkan total 10 ion hidrogen sedangkan FADH2 menghasilkan 6 ion hidrogen.

Apabila kita melakukan perhitungan total dari glikolisis, berikut rangkumannya untuk setiap satu molekul glukosa:
Reaksi Hasil NADH dan FADH2 Jumlah proton yang dipompakan
Glikolisis 2 NADH 20
Siklus Krebs 8 NADH 80
2 FADH2 12
Total 112

Dari sekitar 112 proton, maka kurang lebih akan menghasilkan 22 – 37 ATP (3-5 proton per ATP). Oleh sebab itu, total ATP dari satu glukosa bisa menghasilkan 26 – 41 ATP (tambahan 2 ATP dari glikolisisi dan 2 GTP dari siklus Krebs).
Buku Referensi Kedokteran

Berikut ini adalah beberapa buku teks yang dapat dipilih sebagai bahan pembelajaran khususnya di bidang ilmu dasar kedokteran dan penyakit dalam. Format dapat berupa buku teks fisik maupun e-book (aplikasi Kindle Google Play Store atau Apple Apps Store). Adapun yang sering saya pakai misalnya:
Buku teks ilmu penyakit dalam atau internal medicine:

Harrison’s principles of internal medicine
Goldman-Cecil medicine
Pocket medicine: The Massachusetts General Hospital handbook of internal medicine
dan lain sebagainya
Buku teks kedokteran dasar:
Ganong’s review of medical physiology
Harper’s illustrated biochemistry
Molecular biology of the cell
Atlas of human anatomy (Netter basic science)
dan lain sebagainya

Perlu saya informasikan apabila Anda membeli e-book atau bentuk fisik buku tersebut lewat tautan atau pencarian di laman ini, maka Caiherang akan mendapat komisi dari pembelian tersebut. Dana yang diperoleh akan dipakai untuk pemeliharaan rutin seperti server, plug-in, design software, dan keperluan lainnya baik untu keperluan rutin maupun perbaikan dari website Caiherang ini.

Kesimpulan

Fosforilisasi oksidatif menyumbang sebagian besar energi berupa ATP dari metabolisme aerob. Proses ini terbagi dua yaitu rantai transpor elektron yang menghasilkan gradien elektrokimia yang kemudian dikonversi menjadi ATP oleh kemiosmosis oleh ATP sintase. Proses ini memiliki banyak kesamaan dengan fotosintesis dan bentuk mitokondria memegang peranan penting dalam proses fosforilisasi oksidatif ini.

Siklus Krebs: Siklus Karbon Penghasil Energi di Mitokondria